В июле 1974 года организовано Бюро экспертизы проектов отдела по делам строительства и архитектуры Ульяновского облисполкома.

В 1986 году Бюро экспертизы проектов отдела архитектуры Ульяновского облисполкома переименовано в Управление государственной вневедомственной экспертизы и переведено в состав Главного управления архитектуры и градостроительства Ульяновской области.

Решением исполнительного комитета Ульяновского областного Совета народных депутатов от 03.07.1990 № 257 образовано самостоятельное учреждение экспертизы проектной документации – Управление  государственной вневедомственной экспертизы при облисполкоме. В соответствии с постановлением Главы администрации Ульяновской области от 24.06.1993 за № 230 Управление  государственной вневедомственной экспертизы при облисполкоме переименовано в Управление государственной вневедомственной экспертизы  при администрации области.

Образование Ульяновского управления Главного управления государственной вневедомственной экспертизы при Государственном комитете Российской Федерации по строительству и жилищно-коммунальному комплексу  юридически закреплено приказом Главгосэкспертизы России от 05.02.2004 № 9 «О создании Управления Главгосэкспертизы по Ульяновской области». На основании принятых решений постановлением Главы администрации Ульяновской области от 25.02.2004 № 19 Управление государственной вневедомственной экспертизы при администрации Ульяновской области было ликвидировано  30.12 2004.

Ульяновское Управление Главгосэкспертизы России по Ульяновской области осуществляло  полномочия по организации и проведению государственной экспертизы предпроектной и проектной документации до 2007 года. В соответствии с приказом Главгосэкспертизы России от 18.12.2006 № 62 Управление Главгосэкспертизы России по Ульяновской области прекратило свое существование в феврале 2007 года.

В связи с внесением Федеральным законом от 18.12.2006 № 232-ФЗ  изменений в Градостроительный кодекс Российской Федерации часть полномочий в области организации и проведения государственной экспертизы проектной документации и результатов инженерных изысканий переданы субъектам Российской Федерации.

В целях реализации положений градостроительного законодательства распоряжением Правительства Ульяновской области от 12.02.2007 № 63-пр принято решение о создании ОГУ «Ульяновскгосэкспертиза».

Распоряжением Правительства Ульяновской области от 25.12.2007 № 806-пр создано областное автономное учреждение «Ульяновскгосэкспертиза» путем изменения типа существующего областного государственного учреждения «Ульяновскгосэкспертиза». От имени Ульяновской области учредителем ОАУ «Ульяновскгосэкспертиза» выступило Министерство строительства Ульяновской области.

Распоряжением Правительства Ульяновской области от 08.09.2008 № 477-пр установлено, что функции и полномочия учредителя от имени Ульяновской области у Министерства строительства Ульяновской области изъяты и переданы Правительству Ульяновской области.